BFL innehåller inga straffbestämmelser. Den som t.ex. åsidosätter sin bokföringsskyldighet enligt BFL kan göra sig skyldig till bokföringsbrott enligt straffbestämmelserna i Brottsbalken, BrB.
I 11 kap. 5 § BrB anges att den som uppsåtligen eller av oaktsamhet åsidosätter bokföringsskyldighet enligt BFL genom att i bokföra affärshändelser eller arkivera räkenskapsinformation eller genom att lämna oriktiga uppgifter i bokföringen eller på annat sätt, döms för bokföringsbrott om rörelsens förlopp, ekonomiska resultat eller ställning till följd härav inte kan i huvudsak bedömas med ledning av bokföringen. Straffskalan för bokföringsbrott är fängelse i högst två år eller, om brottet är ringa, till böter eller fängelse i högst sex månader.
Bokföringsbrottet gäller enbart en juridisk person som bedriver näringsverksamhet.
Den ”enklaste” formen av bokföringsbrott att konstatera är att bokföringen helt saknas. I övrigt är det ofta fråga om bedömning.